Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Gpc1Q9QZF2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpc1Q9QZF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpc1Q9QZF2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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