Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Phtf1Q9QZ09 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms