Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh11Q9QYF1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rdh11Q9QYF1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms