Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim44Q9QXA7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim44Q9QXA7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms