Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
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