Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Col5a3Q9JLI2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a3Q9JLI2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms