Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hmgn5Q9JL35 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hmgn5Q9JL35 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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