Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Usp29Q9ES63 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usp29Q9ES63 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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