Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Wdr61Q9ERF3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms