Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ParvgQ9ERD8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ParvgQ9ERD8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms