Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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