Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Smim23Q9DAL0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Smim23Q9DAL0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms