Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ift43Q9DA69 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ift43Q9DA69 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms