Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hcfc2Q9D968 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms