Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl4Q9D8E6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms