Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Cldn22Q9D7U6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn22Q9D7U6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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