Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Tmem54Q9D7S1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmem54Q9D7S1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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