Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Echdc3Q9D7J9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms