Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9bQ9D6E4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms