Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc130Q9D516 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc130Q9D516 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms