Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc6Q9D4E6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms