Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ube2cQ9D1C1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ube2cQ9D1C1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms