Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hddc3Q9D114 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms