Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shisa9Q9CZN4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms