Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Snf8Q9CZ28 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms