Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snx7Q9CY18 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms