Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxxc1Q9CWW7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms