Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rhobtb3Q9CTN4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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