Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rprd1bQ9CSU0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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