Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim8Q9CQQ0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
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