Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms