Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rdm1Q9CQK3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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