Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms