Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab5aQ9CQD1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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