Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
1700029P11RikQ9CQ68 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms