Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atg3Q9CPX6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms