Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NsmfQ99NF2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms