Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atoh8Q99NA2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atoh8Q99NA2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atoh8Q99NA2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atoh8Q99NA2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Atoh8Q99NA2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atoh8Q99NA2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atoh8Q99NA2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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