Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrrtQ99MR6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms