Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Vmp1Q99KU0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Vmp1Q99KU0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Vmp1Q99KU0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Vmp1Q99KU0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Vmp1Q99KU0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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