Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms