Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hps4Q99KG7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hps4Q99KG7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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