Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TirapQ99JY1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms