Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tspan1Q99J59 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms