Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctu1Q99J10 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ctu1Q99J10 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctu1Q99J10 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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