Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Rnf144aQ925F3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rnf144aQ925F3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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