Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8VDP2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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