Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc8Q8VD72 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc8Q8VD72 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms