Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Casc3Q8K3W3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Casc3Q8K3W3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Casc3Q8K3W3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Casc3Q8K3W3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Casc3Q8K3W3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms