Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrit1Q8K099 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms